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首頁 > 商務會議 > 醫療醫學會議 > 2019 TCGA高通量數據挖掘研究技術會議(11月上海班) 更新時間:2019-11-07T16:39:35

2019 TCGA高通量數據挖掘研究技術會議(11月上海班)
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2019 TCGA高通量數據挖掘研究技術會議(11月上海班)

會議時間:2019-11-22 09:00至 2019-11-24 18:00結束

會議地點: 上海  詳細地址會前通知   周邊酒店預訂

會議規模:30人

主辦單位: 慕臻醫學科研平臺 河南慕臻生物科技有限公司

發票類型:增值稅普通發票
領取方式:現場領取 會后快遞 會前快遞 
發票內容: 會議費 會務費 會議注冊費 
參會憑證:現場憑電話姓名參會

會議通知

會議內容 主辦方介紹


2019 TCGA高通量數據挖掘研究技術會議(11月上海班)

2019 TCGA高通量數據挖掘研究技術會議(11月上海班)宣傳圖

各企事業單位:

癌癥是臨床醫學中非常重要的疾病方向。TCGA數據庫中包含了常見了40種癌癥方向(含30000個樣本)的高通量數據及臨床信息。大家對TCGA數據庫的使用近幾年也在逐漸增加。因此,需要我們自己掌握高通量數據挖掘的能力以及邏輯性的生信分析思路,從海量信息中獲得自己想要的關鍵基因

隨著大數據時代的到來,各種生物類公共數據庫井噴,其中就包括癌癥領域熟為人知的癌癥基因圖譜The Cancer Genome Atlas (TCGA)數據庫。臨床科研人員有沒有一種方法可以不做實驗不查病史,直接調用現有數據發表SCI論文呢?癌癥公共數據庫即提供了這樣的可能。本次學習班講授癌癥領域熟為人知的癌癥基因圖譜The Cancer Genome Atlas(TCGA)數據庫。TCGA由NCI牽頭,作為美國攻克癌計劃的一個大項目,系統提供了癌癥多組學測序和芯片數據,包括Gene expression, DNA methylation, Copy Number Variation, Mutation等結果,同時也附有相應各測序樣本的完整臨床資料。TCGA為腫瘤基礎醫學和轉化醫學研究者提供了海量的基因組數據和與其關聯的臨床數據,這為挖掘有意義的基因組變化和發現影響腫瘤起始、發展、分化、轉移等生物學機制提供了海量數據基礎。

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學習目標:

通過整整兩天的培訓,掌握TCGA數據庫的使用、下載及分析思路和實用操作知識點。

1:T CGA數據下載與臨床數據清理

2:差異表達分析、火山圖、pathway分析

3:TCGA臨床數據基線分析及功能富集分析

4:生存分析,生存作圖

5:臨床預測模型建構

授課方式:

1、課堂講授與上機操作相結合;

2、專題研討與案例講解分析結合;

3、課后加微信群答疑。

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會議日程

(最終日程以會議現場為準)


時間安排

教學內容

具體介紹

第一天上午

1,R語言介紹

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R語言介紹

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第一天下午

2,TCGA數據庫介紹

3,T CGA數據下載與臨床數據清理

4,表達數據下載與清理

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TCGA數據庫:最全的癌癥高通量數據公共庫(簡介)

TCGA數據庫的產生過程

TCGA數據庫的介紹和使用(包含了轉錄組、基因組、表觀組和臨床信息數據)

TCGA數據庫癌癥數據下載:

RNA-seq數據、miRNA-seq數據、甲基化數據、基因組數據及臨床信息數據的下載
TCGA數據庫癌癥數據的處理

獲得關鍵mRNA、miRNA的表達譜矩陣。

第二天上午

1,?差異表達分析,

2,?火山圖,pathway分析

3,?TCGA臨床數據基線分析

4,?多元Logistic 回歸,

TCGA數據分析

突變分析

差異分析

關聯分析

功能富集分析

GO富集

KEGG pathway富集分析

基線分析

火山圖

第二天下午

5,?生存分析,生存作圖,

6,?缺失值處理

7,?預測模型構建。

生存分析,獲得生存曲線圖(KM曲線,分為臨床因素和基因表達兩種KM曲線)

交互作用,放療敏感性分析

在電腦上快速完成從頭到尾的一套數據實戰

基于一整套流程的思路演練

現場答疑

(本次課程屬于基礎進階班,請參會學員自帶筆記本電腦,會議現場有充足電源插線板,鼓勵大家提前咨詢向會務組及授課老師咨詢本次課程相關內容。)

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會議嘉賓

(最終出席嘉賓以會議現場為準)


主講專家:

湯教授,系蘇州大學公共衛生學院教授,從事生物統計學,高維數據分析,貝葉斯統計學,TCGA及SEER等癌癥數據庫研究多年。系美國阿拉巴馬大學伯明翰分校生物統計系訪問學者,中國衛生信息學會衛生統計理論與方法專業委員會委員,國際生物統計學會中國分會會員。國家自然科學基金通訊評審人,是多個國際SCI雜志的審稿人。對于R軟件及對于論文撰寫發表等方面,有極為獨到深刻的理解。和SCI文章速錄對這些數據進行分析,并從臨床角度出發,把測序數據與臨床資料相結合,為臨床醫生提供科研思路,為自身科研服務。

主講老師先后主持國家自然科學基金3項,在國際主流學術期刊《Bioinformatics》、《Heredity》、《Genetics》、《BMC Bioinformatics》等雜志上發表論文40余篇。參編專著《生物等效性試驗實用指南》一部,獲得2012年教育部高等學校科學技術進步獎1項。湯老師講課風格幽默,對待學員認真負責。深得廣大學員的一致好評。

湯老師寄語:鼓勵大家帶著具體的課題和研究前來參會研究探討,這樣會有更好的授課效果。本次會議我們將著重學習高通量數據挖掘的能力以及邏輯性的生信分析思路,從海量信息中獲得自己想要的關鍵基因!歡迎大家前來參會!另祝我們此次在上海的會議圓滿成功!

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參會指南

會議門票


A類:3200元/人;(含會議費、資料費。食宿可統一安排,費用自理)

B類:4700元/人;(生物信息工程師證書于會議結束后三十個工作日內郵寄。)

參加B類培訓學員可獲得由國家職業資格考試認證中心頒發的《生物信息工程師》證書,該證書全國統一認證使用,聯網注冊。該證書不僅是對您職業技能的肯定,更對您職稱評定、就業求職、晉升加薪等方面有很大幫助。并可作為您的專業技能憑證及法律公正。

注:參加B類培訓學員請提前準備身份證復印件、學歷證明復印件各1份,2寸藍底證件照4張;請于照片背面標注姓名,于會議現場交給會場工作人員。

優惠方式:

1、11月5日前報名學員,減免200元;

2、三人組團報名,每人優惠500元或額外免費贈送一個參會名額。(3+1)

3、學生憑借有效在讀證明優惠200元。

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溫馨提示
酒店與住宿: 為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
退款規則: 活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。

還有若干場即將舉行的 TCGA大會

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會議地點

部分參會單位

主辦方沒有公開參會單位

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